Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1Q8VDF2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1Q8VDF2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Uhrf1Q8VDF2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uhrf1Q8VDF2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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