Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc6a20aQ8VDB9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc6a20aQ8VDB9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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