Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup35Q8R4R6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nup35Q8R4R6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup35Q8R4R6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup35Q8R4R6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup35Q8R4R6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup35Q8R4R6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup35Q8R4R6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup35Q8R4R6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup35Q8R4R6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup35Q8R4R6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 730.6 ms