Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps37bQ8R0J7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps37bQ8R0J7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vps37bQ8R0J7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps37bQ8R0J7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms