Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MyripQ8K3I4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MyripQ8K3I4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MyripQ8K3I4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MyripQ8K3I4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms