Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ncapd2Q8K2Z4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ncapd2Q8K2Z4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ncapd2Q8K2Z4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms