Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf39Q8K2Z2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf39Q8K2Z2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf39Q8K2Z2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms