Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X8

Gtf2h5, General transcription factor IIH subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h5Q8K2X8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2h5Q8K2X8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2h5Q8K2X8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2h5Q8K2X8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms