Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c1Q8K284 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf3c1Q8K284 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c1Q8K284 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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