Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rbm17Q8JZX4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rbm17Q8JZX4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rbm17Q8JZX4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms