Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf628Q8CJ78 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf628Q8CJ78 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf628Q8CJ78 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf628Q8CJ78 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf628Q8CJ78 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf628Q8CJ78 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf628Q8CJ78 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf628Q8CJ78 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf628Q8CJ78 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf628Q8CJ78 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf628Q8CJ78 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf628Q8CJ78 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Znf628Q8CJ78 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms