Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SbsnQ8CIT9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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