Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam20aQ8CID3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam20aQ8CID3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam20aQ8CID3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam20aQ8CID3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms