Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx8Q8CFD4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx8Q8CFD4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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