Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc178Q8CDV0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc178Q8CDV0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ccdc178Q8CDV0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms