Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDT5

4930415O20Rik, MCG18412, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930415O20RikQ8CDT5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930415O20RikQ8CDT5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930415O20RikQ8CDT5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
4930415O20RikQ8CDT5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930415O20RikQ8CDT5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms