Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc38Q8CDN8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc38Q8CDN8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc38Q8CDN8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc38Q8CDN8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms