Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fbxo43Q8CDI2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fbxo43Q8CDI2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo43Q8CDI2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo43Q8CDI2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms