Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A430089I19RikQ8C9W1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A430089I19RikQ8C9W1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms