Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
N4bp3Q8C7U1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
N4bp3Q8C7U1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4bp3Q8C7U1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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