Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc113Q8C5T8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc113Q8C5T8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc113Q8C5T8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc113Q8C5T8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc113Q8C5T8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc113Q8C5T8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc113Q8C5T8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc113Q8C5T8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms