Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg16l1Q8C0J2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg16l1Q8C0J2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg16l1Q8C0J2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg16l1Q8C0J2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg16l1Q8C0J2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms