Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZ81

Lrrtm3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm3Q8BZ81 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrtm3Q8BZ81 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrtm3Q8BZ81 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrtm3Q8BZ81 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrtm3Q8BZ81 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms