Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Skor1Q8BX46 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skor1Q8BX46 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Skor1Q8BX46 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Skor1Q8BX46 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Skor1Q8BX46 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Skor1Q8BX46 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Skor1Q8BX46 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Skor1Q8BX46 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Skor1Q8BX46 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Skor1Q8BX46 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Skor1Q8BX46 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Skor1Q8BX46 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Skor1Q8BX46 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Skor1Q8BX46 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Skor1Q8BX46 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Skor1Q8BX46 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Skor1Q8BX46 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Skor1Q8BX46 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Skor1Q8BX46 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms