Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp38Q8BW70 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp38Q8BW70 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp38Q8BW70 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp38Q8BW70 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
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