Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppfia2Q8BSS9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia2Q8BSS9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppfia2Q8BSS9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms