Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q8BP99 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q8BP99 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q8BP99 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8BP99 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8BP99 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q8BP99 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8BP99 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8BP99 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8BP99 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q8BP99 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8BP99 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8BP99 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8BP99 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8BP99 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8BP99 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8BP99 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8BP99 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8BP99 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8BP99 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8BP99 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8BP99 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8BP99 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8BP99 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8BP99 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8BP99 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8BP99 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8BP99 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8BP99 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8BP99 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8BP99 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8BP99 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8BP99 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8BP99 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8BP99 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8BP99 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8BP99 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8BP99 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8BP99 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8BP99 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8BP99 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8BP99 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8BP99 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8BP99 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8BP99 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8BP99 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8BP99 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8BP99 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8BP99 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8BP99 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8BP99 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8BP99 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8BP99 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8BP99 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8BP99 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8BP99 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8BP99 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8BP99 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8BP99 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8BP99 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8BP99 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8BP99 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8BP99 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8BP99 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8BP99 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8BP99 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8BP99 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8BP99 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8BP99 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8BP99 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8BP99 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8BP99 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8BP99 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8BP99 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8BP99 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8BP99 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8BP99 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8BP99 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8BP99 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8BP99 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8BP99 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8BP99 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8BP99 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8BP99 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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