Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMP6

Acbd3, Golgi resident protein GCP60, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd3Q8BMP6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acbd3Q8BMP6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acbd3Q8BMP6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acbd3Q8BMP6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acbd3Q8BMP6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms