Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ7

Cgrrf1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cgrrf1Q8BMJ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cgrrf1Q8BMJ7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cgrrf1Q8BMJ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cgrrf1Q8BMJ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms