Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AtripQ8BMG1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AtripQ8BMG1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AtripQ8BMG1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AtripQ8BMG1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms