Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hirip3Q8BLH7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hirip3Q8BLH7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hirip3Q8BLH7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Hirip3Q8BLH7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hirip3Q8BLH7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hirip3Q8BLH7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hirip3Q8BLH7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hirip3Q8BLH7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hirip3Q8BLH7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms