Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gcfc2Q8BKT3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gcfc2Q8BKT3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcfc2Q8BKT3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms