Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKF1

Polrmt, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolrmtQ8BKF1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PolrmtQ8BKF1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PolrmtQ8BKF1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PolrmtQ8BKF1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PolrmtQ8BKF1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms