Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup93Q8BJ71 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup93Q8BJ71 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup93Q8BJ71 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms