Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
D130040H23RikQ8BII3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
D130040H23RikQ8BII3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
D130040H23RikQ8BII3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
D130040H23RikQ8BII3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms