Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD8

Pcmtd2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd2Q8BHD8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcmtd2Q8BHD8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmtd2Q8BHD8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcmtd2Q8BHD8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcmtd2Q8BHD8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcmtd2Q8BHD8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcmtd2Q8BHD8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcmtd2Q8BHD8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms