Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4cQ811C2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4cQ811C2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atg4cQ811C2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg4cQ811C2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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