Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkhd1l1Q80ZA4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkhd1l1Q80ZA4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkhd1l1Q80ZA4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkhd1l1Q80ZA4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkhd1l1Q80ZA4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkhd1l1Q80ZA4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkhd1l1Q80ZA4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pkhd1l1Q80ZA4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkhd1l1Q80ZA4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkhd1l1Q80ZA4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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