Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg2bQ80XK6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atg2bQ80XK6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg2bQ80XK6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg2bQ80XK6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms