Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srrm3Q80WV7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srrm3Q80WV7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms