Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ube3cQ80U95 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ube3cQ80U95 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ube3cQ80U95 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ube3cQ80U95 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms