Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnphQ80U23 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnphQ80U23 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnphQ80U23 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnphQ80U23 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnphQ80U23 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnphQ80U23 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SnphQ80U23 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnphQ80U23 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnphQ80U23 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SnphQ80U23 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnphQ80U23 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms