Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf8Q80TJ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Phf8Q80TJ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf8Q80TJ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms