Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSP5

Vtcn1, V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vtcn1Q7TSP5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vtcn1Q7TSP5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vtcn1Q7TSP5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vtcn1Q7TSP5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vtcn1Q7TSP5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vtcn1Q7TSP5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms