Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf18Q7TS55 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf18Q7TS55 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf18Q7TS55 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms