Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Actn1Q7TPR4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Actn1Q7TPR4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Actn1Q7TPR4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Actn1Q7TPR4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Actn1Q7TPR4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms