Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nphp3Q7TNH6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nphp3Q7TNH6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nphp3Q7TNH6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nphp3Q7TNH6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms