Protein–RNA interactions for Protein: Q78TU8

Fam107a, Family with sequence similarity 107, member A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107aQ78TU8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam107aQ78TU8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam107aQ78TU8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam107aQ78TU8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam107aQ78TU8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam107aQ78TU8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam107aQ78TU8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam107aQ78TU8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam107aQ78TU8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam107aQ78TU8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam107aQ78TU8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam107aQ78TU8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam107aQ78TU8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam107aQ78TU8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam107aQ78TU8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam107aQ78TU8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms