Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snd1Q78PY7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snd1Q78PY7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snd1Q78PY7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snd1Q78PY7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 806 ms