Protein–RNA interactions for Protein: Q78IQ7

Slc39a4, Zinc transporter ZIP4, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a4Q78IQ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc39a4Q78IQ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc39a4Q78IQ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc39a4Q78IQ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc39a4Q78IQ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms